Andrea Perugini si è diplomato in pianoforte ed in organo e composizione organistica presso il Conservatorio di Bergamo, studiando e perfezionandosi con Carla Torta Jacobi, Luigi Toja e Bruno Bettinelli.

È stato pianista collaboratore della scuola di canto lirico e cameristico di Floriana Cavalli.

Ha meritato la borsa di studio «Macoggi» presso l’omonimo corso di perfezionamento pianistico organizzato a Varenna dalla Gioventù Musicale Italiana.

Svolge attività concertistica come solista al pianoforte e all’organo, in diverse formazioni cameristiche e collaborando con varie orchestre.

Ha diretto la Cappella Musicale «Attilio Giordani» di Arese, la «Corale Monzese», e dirige stabilmente la Cappella Musicale «Pueri Cantores» di Rho e il Coro «Giuseppe Verdi» di Sesto San Giovanni.

È ideatore  e direttore artistico del Festival Organistico Internazionale «Luigi Toja» di Rho.

È stato invitato a far parte della giuria al Concorso Pianistico Internazionale «Bruno Bettinelli» di Treviglio.

Vincitore di vari concorsi è docente di pianoforte presso il Liceo Musicale Statale «Carlo Tenca»  di Milano e, dal 1986, è docente di pianoforte e organo presso l’Istituto Musicale «Rusconi» di Rho.